Следующим шагом стало подписание 12 мая 1997 года договора «О мире и принципах взаимоотношений между Российской Федерацией и Чеченской Республикой Ичкерия», в котором стороны договорились навсегда отказаться от применения и угрозы применения силы при решении любых спорных вопросов, строить свои отношения в соответствии с общепризнанными принципами и нормами международного права. Вопрос о статусе Чеченской Республики в договоре формально обойден, но подразумевалось, что в перспективе он будет поставлен к контексте международного права.В Чечне произошел резкий процесс деурбанизации, связанный с бомбардировками и разрушениями крупнейших городов, а также интенсивным оттоком из них населения. Существенно возросла доля сельского населения.
Отсрочка решения вопроса о статусе Чечни сыграла важную роль в завершении вооруженных действий. Однако вопрос о статусе Чечни оставался камнем преткновения в развитии сотрудничества федеральных органов государственной власти и органов государственной власти Чечни. Взаимоприемлемое решение вопроса о статусе Чечни не могло быть найдено: консенсус в чеченском обществе относительно независимости республики и давление со стороны внешних экстремистских сил ограничивали возможности чеченской стороны к компромиссам, а для органов государственной власти России были неприемлемы действия, выходящие за конституционно-правовое поле.
Для политологов было очевидно, что признание независимости Чечни не снимет напряженности, а, наоборот, простимулирует террористический режим и положит начало новой эскалации межэтнических столкновений, нестабильности в Северо-Кавказском регионе. Российское общественное мнение отвергало возможность предоставления в той или иной форме независимости Чечне. Ни один здравый политик, ни одна серьезная партия не разделяли тезис «отпустить Чечню», который означал легализацию рассадника терроризма и криминального беспредела.
Хотя многие политики утверждали, что быстрого решения проблемы Чечни исключительно военными средствами не существует, по крайней мере, до президентских выборов в России, тогдашние президент Борис Ельцин и премьер-министр Владимир Путин приняли решение массированного использования военной силы. Значимыми факторами принятия такого решения стали поддержка общественным мнением России силового варианта против мятежной Чечни, особенно возросшая после кровавых взрывов в российских городах и осуждения мировым сообществом террористической деятельности чеченских экстремистов.
Воздушные удары с начала сентября неизбежно вызвали гибель многих гражданских лиц и бегство от бомбежек и артобстрелов гражданского населения. Численность перемещенных лиц, нашедших прибежище в основном в Ингушетии, достигла 200 тыс. человек. Непосредственный ввод войск на территорию Чечни привел к тому, что уже к концу октября 1999 года под контролем федеральных войск находилось две трети территории Чечни.
Дальнейший ход второй чеченской кампании показал, что с одной стороны подготовленная российская армия при поддержке общественного мнения России успешно выполнила поставленную задачу и разгромила все крупные бандформирования полевых командиров, но с другой стороны - проблема вынужденных переселенцев не только не была решена, но еще больше обострилась, став самодавлеющим фактором.
В ходе второй чеченской кампании с 1 октября 1999 года по 28 мая 2001 года потери федеральных вооруженных сил составили 3,1 тыс. человек убитых и 9,2 тыс. человек раненых. По сведениям военных, каждая неделя добавляет к цифре потерь 15-20 убитых и 50-60 раненых. По примерным оценкам около 13-14 тыс. человек потеряли чеченские бандитские формирования.
В целом же во время двух военных кампаний в Чечне были зафиксированы самые значительные людские потери среди гражданского населения. Следует отметить, что существуют большие расхождения в определении числа таких жертв. Пропаганда сепаратистов утверждала, что только к февралю 1995 года потери составили 43-45 тыс. чел., из них, по словам бывшего первого президента Чечни Дудаева, около 18-20 тыс. - российские военнослужащие. По утверждению бывшего вице-президента Чечни Яндарбиева, в Чечне было убито около 100 тыс., 37 тыс. чел. ранено; около 8 тыс. чел. тяжело раненых. Оппозиция в Москве была склонна предполагать, что российские власти занижают численность убитых, например Григорий Явлинский заявил о 100 тыс. погибших в чеченском конфликте. В этом вопросе его поддержал Геннадий Зюганов и т. д.
Практически отсутствуют достоверные оценки погибших среди гражданского населения, хотя большинство жертв составляют мирные жители, пострадавшие от военных действий и актов насилия. Приводившиеся Александром Лебедем сведения о 80 тыс. убитых и 240 тыс. раненых и искалеченных в Чечне в ходе первой кампании оспаривались бывшим главой МВД генералом Анатолием Куликовым, по данным которого погибло около 18,5 тыс. чел.
Согласно оценкам правозащитных организаций, в Чечне только за первый год боевых действий погибло от 20 до 30 тысяч мирных жителей. Оценки правозащитного общества «Мемориал», основанные на массовом опросе жителей Грозного, - за первые три месяца войны погибло до 25 тыс. человек. В любом случае, на этот период наиболее интенсивных боевых действий, сопровождающийся бомбардировками и обстрелами, приходится подавляющая часть потерь гражданского населения в Чеченской войне - минимум 80-85%. По-видимому, численность погибших мирных жителей в результате чеченского конфликта составляет 25-30 тыс. человек. Прямые материальные потери в зонах конфликтов составляют около 13 млрд. долл., из них 9,5 млрд. - в конфликтах на Кавказе. Наиболее значительный материальный ущерб зафиксирован в Чечне, который довольно сложно оценить. В начале 1995 года в результате военных действий в предшествующем году республике был нанесен ущерб в размере 1-1,3 млрд. долл. В ходе боев к началу февраля 1995 года было разрушено 1,3 тыс. жилых домов (2,3 млн. кв. м.), 76 детсадов, 74 школы, 13 больниц, 17 мостов, 180 км автодорог. Только на восстановление жилья требовалось 1,8 трлн. руб. (0,5 млрд. долл.).
В последующем оценки ведомств резко возросли: на восстановление АПК запрашивается 5 трлн. руб., ущерб СКЖД оценивается свыше 1 трлн. руб. и т. д. Указ Президента России о выделении на восстановление Чечни 16 трлн. руб. и 1 млрд. долл. появился не без давления со стороны федеральных ведомств и правительства Чечни. Реальный ущерб скорее всего не всегда совпадает с ведомственными оценками, преследующими свои цели.
Прямой материальный ущерб, понесенный Чеченской Республикой от конфликта, видимо, не может превышать стоимостной оценки национального богатства республики, т. е., по весьма приближенным прикидкам, порядка 20 млрд. долл. Скорее всего, прямой материальный ущерб от войны в Чечне, включающий ущерб не только республики, но и всей Российской Федерации, составляет 5-6 млрд. долл. но, возможно, и приближается к оценкам Лебедя - 12-15 млрд. долл. Военный конфликт в Чеченской республике привел и к нескольким демографическим последствиям. Во-первых, численность населения в регионе существенно уменьшилась. По данным московских властей в 2001 году оно составляло 573,9 тыс. человек, по данным паспортно-визовой службы МВД - 995,5 тыс., по данным местных администраций - 1166,3 тыс., по данным Датского совета по беженцам - 733,9 тыс. человек.
Важным демографическим последствием стало кардинальное изменение этнического состава населения в республике. На 2001 год чеченцы составляли подавляющую часть населения - 97,4% (вместо 70,7% в момент переписи 1989 года). В результате миграционного оттока и существенных демографических потерь доля русских сократилась с 29% до 1,3%. По оценкам экспертов численность русского населения в регионе сократилась на протяжении 1990-х годов по меньшей мере на 300-360 тыс. человек. В Чечне произошел резкий процесс деурбанизации, связанный с бомбардировками и разрушениями крупнейших городов, а также интенсивным оттоком из них населения. Существенно возросла доля сельского населения, которая на период окончания второй чеченской кампании составляла около 80% от общего населения республики. Это изменение связано, прежде всего, с миграцией в пределах Чечни.
